É uma categoria específica de fundação (ou entidade) que viabiliza recursos para o desenvolvimento da pesquisa nas diversas áreas da Ciência e da Tecnologia. As FAPs são entidades que integram o Sistema Nacional de Ciência e Tecnologia, ao lado de instituições tradicionais como o Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) e a Financiadora de Estudos e Projetos (Finep). São entidades que exercem papel significativo nas definições da política científico-tecnológica nacional.
A primeira das FAPs do Brasil foi fundada em 1962 no estado de São Paulo, e se denomina Fundação de Amparo à Pesquisa do estado de São Paulo (Fapesp). A partir desta, outros estados brasileiros passaram a estruturar suas próprias fundações, baseados no modelo da Fapesp. Em 1964, o estado do Rio Grande do Sul fundou a Fapergs (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul). Em 1980, o estado do Rio de Janeiro fundou a Faperj (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro). A Fapemig (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais foi criada em 1985. Mas foi durante a década de 90 que o país passou a ver o crescimento das FAPs no restante dos estados brasileiros. Atualmente, as FAPs são as seguintes:
Fundação de Amparo à Pesquisa de Alagoas (Fapeal)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (Fapemig)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul (Fapergs)
Fundação de Apoio à Ciência e Tecnologia do Distrito Federal (FAP-DF)
Fundação de Apoio à Pesquisa do Estado da Paraíba (Fapesq)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Paraíba (Fapep)
Fundação de Ciência e Tecnologia de Santa Catarina (Funcitec)
Fundação de Amparo à Pesquisa de Sergipe (FAP-SE)
Fundação Cearense de Amparo à Pesquisa (Funcap)
Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia de Pernambuco (Facepe)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Piauí (Fapepi)
Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (Faperj)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Mato Grosso (Fapemat)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (Fapesp)
Fundação de Apoio ao Desenvolvimento do Ensino, Ciência e Tecnologia do Estado do Mato Grosso do Sul (Fundect)